На заглавную страницу
На главную страницу первого семестра

Клеточный фактор интеграции (IHFA_ECOLI)

  1. Краткое название белка — IHFA_ECOLI
  2. Полное название организма — Escherichia coli, K-12
  3. Название гена — ihfA
  4. Номер локуса в бактериальной хромосоме — b1712
Последовательность в формате FASTA:

>IHFA_ECOLI integration host factor alpha-subunit
MALTKAEMSEYLFDKLGLSKRDAKELVELFFEEIRRA
LENGEQVKLSGFGNFDLRDKNQRPGRNPKTGED
IPITARRVVTFRPGQKLKSRVENASPKDE

Bычисления с помощью Excel

Процентное содержание аминокислот в белке IHFA_ECOLI

A (Аланин) 6% M (Метионин) 2%
C (Цистеин) 0% N (Аспарагин) 5%
D (Аспарагиновая кислота) 6% P (Пролин) 5%
E (Глутаминовая кислота) 11% Q (Глутамин) 3%
F (Фенилаланин) 6% R (Аргинин) 10%
G (Глицин) 7% S (Серин) 5%
H (Гистидин) 0% T (Треонин) 4%
I (Изолейцин)3% V (Валин) 5%
K (Лизин) 10% W (Триптофан) 0%
L (Лейцин) 10% Y (Тирозин) 1%

Длина последовательности — 99 а.о.

Молярная масса — 11355,41 г/моль.

Средний заряд молекулы при рН=7.0 равен 3.

Относительное содержание гидрофобных (0.5051) (A,C,F,I,L,M,V) и гидрофильных (0.3232) (D,E,H,K,N,Q,R,S) остатков: 0.64.

Скорее всего, белок IHFA_ECOLI не является мембранным, т.к. соотношение гидрофобных к гидрофильным аминокислотам < 1, что не характерно для мембранных белков. Кроме того, он очень маленький: всего 99 аминок ислот, а мембранные более крупные.

В начало


© Сахарова Ирина, 2004.